Inaugurato nel uglio del 2011 il Museo Paleontologico ospita i resti fossili rinvenuti nel bacino che circonda l'alta valle del fiume Nestore e prende il nome di colui che negli anni sessanta, ispezionando sistematicamente e continuamente gli scavi, in qualità di assistente capoturno di Miniera, iniziò a costituire la prima raccolta paleontologica, Luigi Boldrini.

L’Antiquarium Casale San Fulgenzio, situato all’interno dell’area archeologica di Ocriculum, è impostato su una cisterna romana a vista, costituita da un unico ambiente rettangolare coperto con volta a botte (lungo m. 28, largo m. 4,30 e alto m. 4,25) e pertinente ad una villa suburbana costruita in opera cementizia.

[img_assist|nid=90|title=|desc=|link=none|align=left|height=120]Il museo archeologico Claudio Farina, ubicato nell'omonimo Palazzo, comprende reperti archeologici di età greca, etrusca e romana, in particolare corredi funebri delle necropoli etrusche.

All’interno dell’ex Collegio Boccarini è ospitata dal 2001 una delle collezioni archeologiche più importanti dell’Umbria. L’edificio, costruito fra XIII e XIV secolo, dal 1410 fu sede del governatore pontificio, la cui giurisdizione comprendeva Amelia, Orvieto e Terni. All’indomani dell’Unità d’Italia fu trasformato in collegio. Il chiostro a doppio loggiato antistante al museo fu realizzato in forme rinascimentali nel XVI secolo.